王飞¹ , 叶鹏^1,2 , 王正德¹ , 夏茂甜¹ , 沈伟祥¹ , 王海洋¹ , 辛培尧^1,2*

1 西南林业大学, 国家林业局西南风景园林工程技术研究中心, 昆明, 650224; 2 西南林业大学, 西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室, 昆明, 650224
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2020年12月03日    接受日期: 2020年12月11日    发表日期: 2023年04月18日

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为开发华山松大量的稳定性高、特异性强的 SNP 标记，本研究以 279 份华山松针叶为试验材料，利用 SLAF-seq 技术，测序共获得 Reads 数据 3 169 Mb，SLAF 标签 12 952 676 个，多态性 SLAF 标签为1 456 486 个，SLAF 多态性百分率是 11.24%，平均测序深度为 20.52 x，测序平均 Q30 为 96.58%，平均 GC含量为 37.76%。且采用水稻‘日本晴’的测序数据用于评估试验建库的准确性，结果显示本试验比对效率在97%；且水稻‘日本晴’数据的酶切效率在 100%，这表明本试验酶切反应也正常。最终从 12 952 676 个 SLAF标签中检测到了 3 469 074 个群体 SNP 标记。这为华山松分子辅助育种、遗传多样性分析和遗传图谱构建等研究提供理论参考。

华山松(Pinus armandii)；SLAF-seq；SNP 位点